各話ラストで「つづく」の
テロップを挿入する演出は、『
トップをねらえ!』から歴代ガイナックスオリジナル作品へと引き継がれている。また、最終話サブタイトルに
SF小説の題名を流用している作品も多いが、これは監督である
庵野秀明の趣味である(「 トップをねらえ2!」はトップの続編であるため、「天元突破グレンラガン」に関してはシリーズ構成の
中島かずきがこうしたガイナックス作品の傾向を知って、敢えて踏襲したため)。
比較的緩く、ファンによるエヴァンゲリオンの画像のウェブ上での使用を部分的に許諾する、公式サイトのトップページでの
漫画家・
イラストレーターとのコラボレーション、上記のような所属スタッフの他社への出向・制作協力
[作画(動画・原画・作監)担当の他、監督・デザイン作業としての出向も珍しくないが、あくまで「企業」としてではなく「個人」として関わっている為、自社の公式サイト・関わった作品のエンドクレジットには掲載されない。]、公式同人誌のコンスタントな発行等を積極的に行うなど、他社と一線を画いた活動で注目されている。本社のスタッフとの協同作業を行う機会が多い外部の監督として、
大地丙太郎・
細田守・
押井守が挙げられる
[ただし、押井は「元」スタッフとの交流・共同作業が多い(例:樋口真嗣等)。]。